【資料圖】
植物根部有著密密麻麻的微生物群落,這些微生物和植物的生長息息相關(guān),形成了一個復(fù)雜而精彩的生態(tài)系統(tǒng)。盡管在目前的認(rèn)知中,熒光原位雜交技術(shù)可用于微生物的可視化,但傳統(tǒng)的成像方法受到熒光基團(tuán)光譜重疊的限制,能同時表征的物種豐富度有限。因此,需要發(fā)展新的微生物成像技術(shù),以更好地表征和解析微生物群落的空間結(jié)構(gòu)。
近期,中科院深圳先進(jìn)院合成生物學(xué)研究所團(tuán)隊成功開發(fā)可容錯編碼的序貫熒光原位雜交(sequential error-robust fluorescence in situ hybridization,SEER-FISH)技術(shù),該方法可識別復(fù)雜群落中的不同微生物物種,在單細(xì)胞尺度上原位解析微生物物種之間以及微生物-宿主之間的相互作用,進(jìn)而研究其生態(tài)規(guī)律和生理功能;在微米尺度上繪制了擬南芥根系定植的多細(xì)菌物種的生物地理分布,觀測到不同微生物物種在根系上的空間異質(zhì)性定植,以及在受到宿主代謝物擾動后微生物的空間分布變化和物種空間關(guān)聯(lián)改變。相關(guān)研究成果在《Nature Communications》雜志上,題為“Spatial profiling of microbial communities by sequential FISH with error-robust encoding”。
總體來說,SEER-FISH技術(shù)拓展了熒光分子的種類與雜交成像輪數(shù)之間的指數(shù)組合,從而實現(xiàn)對微生物群的全部物種的同時成像。這一成果為進(jìn)一步研究微生物群落的結(jié)構(gòu)和生態(tài)系統(tǒng)提供了新的可能性,是研究微生物群落的生態(tài)和功能的重要工具。
注:此研究成果摘自《Nature Communications》雜志,文章內(nèi)容不代表本網(wǎng)站觀點和立場,僅供參考。
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